עם כל הכבוד לאיש ,לא הרבה אנשים הכירו את בן-ציון נתניהו ואת פועלו הרחב.
תפיסתו יצאה מתוך הנחה שתחילת האנטישמיות לא החלה בגרמניה ובצרפת (כפי שרבים סוברים) אלא ע"י שלטון האינקוויזיציה אשר בקשה לטהר מספרד ופורטוגל את "האנוסים".
כמוכן ,הוא קישר בין שלטון האינקווזיציה לבין שירותי הבטחון של המפלגה הנאצית .
וכן ,טען בן-ציון נתניהו שהאנטישמיות אינה אלא שם כולל למגוון רחב של תופעות שנאה אשר רדפו את היהודים בשל זהותם ומוצאם.
ומכאן ניתן להבין מאיפה לוקח ביבי את ההשוואה בין מה שקרה ביבשת אירופה בזמן מלחמת העולם השנייה ,לבין שלטון האייתולות באיראן.
על גישתו המחקרית שילם נתניהו מחיר כפול, מחד הוא הניח הנחה שונה אשר לא הייתה מקובלת בזמנו על החוקרים הישראלים,ולכן הוא נאלץ לערוך את עבודותיו המחקריות באונברסיטת "קורנל" בארצות-הברית.
וכן השקפתו הימנית-קיצונית הפריעה לו להשתלב במוסדות האקדמיים בישראל אשר נוטות לכיוון שמאל .
למרות זאת הוא היה אדם מבריק ,חד מחשבה אשר היה לו הרבה מה להציע לציבור בישראל וחבל שאדם כזה פוספס ע"י האקדמיה הישראלית.